Di babak kedua, kondisi Indonesia semakin sulit, karena dua gol dalam tempo menit dicetak Malaysia. Gol ketiga disumbangkan oleh Shivan Asokan lewat sundulan pada menit ke-47 dan gol keempat lewat sepakan penalti M Hadi Fayyadh pada menit ke-52.
Malysia yang bermain baik, dan menerapkan permainan yang agresif dan terus menekan, membuat kesulitan skuad Indra Sjafri untuk mengembangkan permainan. Sampai akhir pertandingan, skor tetap 4-1 untuk kemenangan Malaysia.
93' FT. Malaysia 4-1 Indonesia https://t.co/rRsEmcRxjp #masidn #afcu19q #matchdaygoal pic.twitter.com/9SpemMFKDp
— GOAL Indonesia (@GOAL_ID) November 6, 2017
Dalam laga ini, Indra Sjafri melakukan rotasi pemain. Di sektor belakang, ada dua nama yang tidak dimainkan pada laga terakhir, Kadek Maheswara dan Firza Andika. Pada bagian tengah, Asnawi Mangkualam Bahar dan Witan Sulaeman kembali masuk daftar susunan pemain utama.
Di pos sayap kiri, Indra Sjafri menurunkan Feby Eka Putra. Sedangkan yang ditugaskan menggantikan peran Egy Maulana ialah Muhammad Iqbal.
Pemilihan pemain tersebut memancing netizen berkomentar di akun instagram PSSI. Banyak yang merasa timnas U-19 Indonesia meremehkan pertandingan melawan Malaysia.